衔接上季。忍者们离开神秘岛，但妮娅的水系元素突然失去了控制，在寻找问题之时，突然收到来自海底的一个能量波，于是闯入了水下五千英寻的无尽大海神殿，里面生活着许多海怪（莫罗匹恩人），他们被一个叫特里玛的章鱼怪领导着，但是他的儿子卡尔玛却内心邪恶，他决定用两个护身符（风暴护身符和海浪护身符）来唤醒海上巨蟒“沃杰拉”，来造出惊人的破坏力。卡尔玛为了实现计划，害死了他的爸爸并嫁祸忍者，后得到两个护身符，唤醒了沃杰拉，水淹忍者城。忍者城居民的处境十分危险。本多玛击碎卡尔玛的权杖，卡尔玛失去对沃杰拉的控制，被沃杰拉吞食。妮雅为了击败沃杰拉，不顾自身与海洋融为了一体，最终打败了沃杰拉，妮雅将海水带出忍者城，自己也留在了海水中。
黛维·切斯 克里斯·桑德斯 蒂亚·卡雷尔 戴维·奥格登·施蒂尔斯 凯文·麦克唐纳德 文·瑞姆斯 迪·布拉雷·贝克尔 凯文·迈克尔·理查德森 杰夫·贝内特 佐伊·考德威尔 特蕾丝·麦克尼尔 库内瓦·穆克 莉莉娜·穆米 罗伯·鲍森 弗兰克·维尔克
詹妮弗·黑尔 罗伯·鲍森 科里·伯顿 露西·泰勒 苏珊妮·布莱克史丽 特蕾丝·麦克尼尔 霍兰德·泰勒 克里斯托弗·丹尼尔·巴恩斯 弗兰克·维尔克 杰夫·贝内特 鲍伯·伯根 苏珊·布卢 罗德格尔·邦帕斯 詹妮弗·达林 保罗·伊丁 雪莉·琳恩 米凯·麦高万 菲尔·普洛克特 比尔·法玛尔
威尔·阿奈特 罗莎里奥·道森 拉尔夫·费因斯 迈克尔·塞拉 扎克·加利凡纳基斯 珍妮·斯蕾特 苏珊·本尼特 玛丽亚·凯莉 查宁·塔图姆 乔纳·希尔 亚当·德维尼 柯南·奥布莱恩 道格·本森 比利·迪·威廉姆斯 杰森·曼楚克斯 艾迪·伊扎德 赛斯·格林 佐伊·克罗维兹 凯特·米库奇 瑞琪·琳德赫姆 杰梅奈·克莱门特 艾丽·坎伯尔
林原惠美 川村万梨阿 久川绫 饭冢雅弓 三木真一郎 有本钦隆 藤本让 宝龟克寿 中岛聪彦 中博史 高户靖广 卷岛直树 千叶一伸 长嶝高士 杉本优 大原沙耶香 高森奈绪 小野井仁 细井治 渡边久实子 速水奖