衔接上季。忍者们离开神秘岛，但妮娅的水系元素突然失去了控制，在寻找问题之时，突然收到来自海底的一个能量波，于是闯入了水下五千英寻的无尽大海神殿，里面生活着许多海怪（莫罗匹恩人），他们被一个叫特里玛的章鱼怪领导着，但是他的儿子卡尔玛却内心邪恶，他决定用两个护身符（风暴护身符和海浪护身符）来唤醒海上巨蟒“沃杰拉”，来造出惊人的破坏力。卡尔玛为了实现计划，害死了他的爸爸并嫁祸忍者，后得到两个护身符，唤醒了沃杰拉，水淹忍者城。忍者城居民的处境十分危险。本多玛击碎卡尔玛的权杖，卡尔玛失去对沃杰拉的控制，被沃杰拉吞食。妮雅为了击败沃杰拉，不顾自身与海洋融为了一体，最终打败了沃杰拉，妮雅将海水带出忍者城，自己也留在了海水中。
丹·卡斯泰兰尼塔 朱莉·卡夫娜 南茜·卡特莱特 雅德丽·史密斯 汉克·阿扎利亚 哈里·谢尔 潘蜜拉·海登 露西·泰勒 麦琪·罗丝威尔 特蕾丝·麦克尼尔 克里斯·埃杰利 莉娜·邓纳姆 杰米玛·科克 佐莎·马梅特 艾莉森·威廉姆斯 亚当·德赖弗 阿尔顿·布朗 鲍比·莫尼汉 爱德华·詹姆斯·奥莫斯 本·施瓦茨 乔恩·拉威茨 马友友 布莱克.安德森 尼克·克罗尔 凯尔希·格兰莫 克里斯·韦奇 克里斯汀·贝尔 大卫·科波菲尔 斯戴芬·莫昌特 凯特琳·奥尔森 索菲娅·维加拉 乌特卡什·安邦德卡尔 格伦·克洛斯 凯特·